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西安百螢生物科技有限公司 主營:百螢生物圍繞熒光發(fā)光、熒光標(biāo)記、熒光探針等技術(shù)進(jìn)行產(chǎn)品研發(fā),公司產(chǎn)品廣泛用于核酸蛋白定量、細(xì)胞凋亡研究、細(xì)胞信號(hào)通路研究、細(xì)胞及線粒體膜電位檢測(cè)、細(xì)胞器染色、活體示蹤、抗體標(biāo)記等科研領(lǐng)域。
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公司新聞

小螢問號(hào)**十二期(一種有助于確定RNA命運(yùn)的蛋白質(zhì))

這一期我們講的是,一種有助于確定RNA命運(yùn)的蛋白質(zhì)。



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DNA轉(zhuǎn)錄后,RNA可以進(jìn)入許多命運(yùn)。雖然熟悉的途徑可能直接導(dǎo)致蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,但RNA分子本身也可以變得能夠改變基因的表達(dá)。新研究有助于解釋如何實(shí)現(xiàn)RNA序列的命運(yùn)。
在洛克菲勒大學(xué)8月27日發(fā)表的一項(xiàng)研究中,洛克菲勒大學(xué)的科學(xué)家和哥倫比亞大學(xué)的一位同事發(fā)現(xiàn)了一種蛋白質(zhì),它可以識(shí)別RNA序列上的化學(xué)指令標(biāo)簽,這是決策過程中的重要一步。
“這種標(biāo)記,稱為m6A,是四十多年前在RNA序列上發(fā)現(xiàn)的。從那以后,這個(gè)豐富的標(biāo)簽已經(jīng)涉及影響蛋白質(zhì)生產(chǎn)的幾個(gè)重要過程,以及所謂的microRNAs,“研究作者Sohail Tavazoie,Leon Hess副教授,伊麗莎白和Vincent Meyer實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人說。系統(tǒng)癌癥生物學(xué)。(Micro-RNAs是一種小RNA分子,不會(huì)編碼蛋白質(zhì),反而會(huì)降低基因的活性。)
“然而,”Tavazoie說,“一個(gè)揮之不去的問題仍然存在:什么在細(xì)胞核內(nèi)讀取這種化學(xué)標(biāo)簽?我實(shí)驗(yàn)室的研究員ClaudioAlarcón發(fā)現(xiàn)了一種這樣的“讀取”蛋白質(zhì)。由于所涉及過程的基本性質(zhì),這一發(fā)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞的正常功能和**都有影響?!?br /> 該標(biāo)簽稱為m6A,是與腺苷的特定部分連接的甲基,腺苷是RNA序列的一個(gè)組成部分。在之前的工作中,Alarcón及其同事將m6A標(biāo)簽鑒定為microRNA生成的重要調(diào)節(jié)因子。已經(jīng)知道放置這種標(biāo)簽的“作者”蛋白質(zhì)標(biāo)記需要在它們被翻譯成蛋白質(zhì)之前進(jìn)行剪接的RNA分子。許多基因含有必須切除的切片,RNA剪接過程對(duì)細(xì)胞的功能和特性至關(guān)重要。
近期的實(shí)驗(yàn)表明,新發(fā)現(xiàn)的讀取器,一種稱為HNRNPA2B1的蛋白質(zhì),可以識(shí)別RNA上的m6A標(biāo)記,這些標(biāo)記注定了兩種不同的命運(yùn):修剪成為microRNA或剪接以正確生成蛋白質(zhì)。在識(shí)別microRNA前體上的m6A標(biāo)簽后,HNRNPA2B1然后募集切割機(jī)器,負(fù)責(zé)進(jìn)一步修剪和處理這些RNA分子。未來的工作需要了解HNRNPA2B1如何與參與RNA剪接的蛋白質(zhì)相互作用。
研究人員懷疑HNRNPA2B1蛋白是一種閱讀器,因?yàn)樗麄儼l(fā)現(xiàn)它經(jīng)常與m6A標(biāo)簽附著的RNA分子上的相同位點(diǎn)結(jié)合。為了確定所謂的讀者在那里做了什么,該團(tuán)隊(duì)減少了它在細(xì)胞中的存在。
HNRNPA2B1水平降低的細(xì)胞中,他們發(fā)現(xiàn)microRNA的整體表達(dá)發(fā)生了變化,許多microRNA減少了。他們還研究了用于剪接的RNA的影響。在這里,他們也發(fā)現(xiàn)了不同RNA分子拼接的變化,這些變化依賴于m6A標(biāo)簽。
HNRNPA2B1是**個(gè)被鑒定的m6A核讀取器,來自實(shí)驗(yàn)的證據(jù)表明在細(xì)胞核內(nèi)還存在可識(shí)別該標(biāo)簽的額外讀者。
“這種新型m6A閱讀器的發(fā)現(xiàn)對(duì)各種各樣的過程產(chǎn)生了影響,”Alarcón說?!癛NA剪接確立了細(xì)胞中可用蛋白質(zhì)的所有組成成分。同時(shí),microRNA的異常與包括癌癥在內(nèi)的多種**有關(guān)。這項(xiàng)工作也有助于越來越多的證據(jù)表明超出RNA序列的信息,如化學(xué)修飾,可以決定RNA分子的*終命運(yùn)和功能?!?

圖片:準(zhǔn)備閱讀:新識(shí)別的蛋白質(zhì)HNRNPA2B1(綠色)識(shí)別m6A標(biāo)簽,位于細(xì)胞核(藍(lán)色)內(nèi)。肌動(dòng)蛋白絲是細(xì)胞結(jié)構(gòu)的重要元素,呈紅色。圖片來源:Lisa Noble和Gloria Wu

科學(xué)新聞參考:

HNRNPA2B1是m6A依賴性核RNA加工事件的介質(zhì)。ClaudioR.Alarcón,Hani Goodarzi,Hyeseung Lee,Xuhang Liu,Saeed Tavazoie和Sohail F. Tavazoie。Cell,2015。http ://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674 (15)01024-7 。

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